

Bionic Commando vrne bionično okrepljenega Nathana Rada Spencerja, kateremu je glas posodil Mike Patton, nekdanji pevec skupine Faith No More. Spencerju čas ni bil naklonjen 10 let po njegovem junaškem porazu Imperials v prvotni igri ga je izdala vlada kateri je zaprisegel, da ji bo služil, zaprli so ga za zločine, ki jih ni storil in ga obsodili na smrt.